Что такое Нейродебиан

Linux-дистрибутив Нейродебиан (NeuroDebian) предназначен для специалистов в области изучения работы головного мозга человека и содержит большое количество высококлассного научного софта в области нейроинформатики.

Суть NeuroDebian хорошо раскрывают слова из культового издания Frontiers in Neuroinformatics:

Просто свободного софта уже недостаточно. Мы должны сделать следующий шаг на пути к созданию целостной вычислительной платформы для нейроученых, которая управлялась бы сообществом.

И разработчики NueroDebian этот шаг сделали.

Ключевые особенности платформы Нейродебиан

• AFNI — набор инструментов для анализа и визуализации данных, полученных с помощью магнитно-резонансных томографов;
• FSL — мощный пакет для диффузионной тензорной визуализации;
• PyMVPA — пакет для выявления закономерностей в больших наборах данных. Реализованы все самые популярные алгоритмы обработки и визуализации (kNN, Ridge Regressions, Sparse Multinomial Logistic Regression и другие).

Другие пакеты разбиты по категориям:

• распределенные вычисления;
• электрофизиология;
• визуализация данных с томографов;
• моделирование нейронных систем;
• базы данных и обучающие материалы по нейробиологии и нейроинформатике;
• психофизика.

Установка NeuroDebian

Интересной особенностью данного дистрибутива является отсутствие установочного образа. На сайте предлагается выбрать дистрибутив, которым вы пользуетесь в настоящий момент, после чего вам будет выдан установочный код. Например, для Debian 7 код выглядит так:

wget -O- http://neuro.debian.net/lists/wheezy.de-md.full | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver pgp.mit.edu 2649A5A9
sudo apt-get update

Как мы видим, сначала в список репозиториев добавляется репозиторий NeuroDebian, затем загружается цифровая подпись, а затем ваш дистрибутив превращается в NeuroDebian штатными средствами.

Перечень дистрибутивов, поддержавающих трансформацию в NeuroDebian:

• Debian GNU/Linux 6.0 (squeeze);
• Debian GNU/Linux 7.0 (wheezy);
• Debian testing (jessie);
• Debian unstable (sid);
• Ubuntu 10.04 LTS "Lucid Lynx" (lucid);
• Ubuntu 12.04 LTS "Precise Pangolin" (precise);
• Ubuntu 12.10 "Quantal Quetzal" (quantal);
• Ubuntu 13.04 "Raring Ringtail" (raring);
• Ubuntu 13.10 "Saucy Salamander" (saucy);
• MS Windows (32bit);
• MS Windows (64bit);
• Mac OS X.