Как перейти с Ubuntu 10.04 на Fedora 15?

Если пользователей немного, то проще сделать полную переустановку, сохранив лишь пользовательские данные, а системные настройки создать вручную заново.

В самом общем случае, рекомендуется сделать копию пользовательских данных в директории /home. Целесообразно сделать архив с директорией /etc (но не разворачивать ее под новым дистрибутивом автоматически). Часто и в директории /root остается что-то полезное, что не следует забывать. Все остальное относится к дистрибутиву и будет заменено. После переустановки нужно заново создать пользовательские учетные данные и восстановить структуру директории /home.

Если пользователей много, то нужно писать писать сценарии миграции, которые сохранят аккаунты пользователей, права доступа, владельцев, настройки программ, системные журналы, а потом все это восстановят на новой системе.